CRAN 任务视图:生存分析

维护者Arthur Allignol,Aurelien Latouche
联系arthur.allignol at gmail.com
版本2023-09-10
URLhttps://CRAN.R-project.org/view=Survival
来源https://github.com/cran-task-views/Survival/
贡献欢迎对本任务视图提出建议和改进,可以通过 GitHub 上的问题或拉取请求,或通过电子邮件发送给维护者地址。有关更多详细信息,请参阅 贡献指南
引用Arthur Allignol,Aurelien Latouche (2023)。CRAN 任务视图:生存分析。版本 2023-09-10。URL https://CRAN.R-project.org/view=Survival。
安装可以使用 ctv 包自动安装本任务视图中的包。例如,ctv::install.views("Survival", coreOnly = TRUE) 安装所有核心包,或 ctv::update.views("Survival") 安装所有尚未安装和更新的包。有关更多详细信息,请参阅 CRAN 任务视图计划

生存分析,在社会科学中也称为事件史分析,或在工程学中称为可靠性分析,处理事件发生的时间。但是,此失效时间可能在相关时间段内未被观察到,从而产生所谓的删失观察。

本任务视图旨在介绍用于分析事件时间数据的有用 R 包。

如果发现任何不准确或缺失的内容,请通过电子邮件或通过在上面链接的 GitHub 存储库中提交问题或拉取请求,告知维护者。

标准生存分析

生存分布的估计

风险估计

测试

回归建模

多状态模型

相对生存

随机效应模型

多元生存

多元生存是指对单位的分析,例如双胞胎或家庭的生存。为了分析此类数据,我们可以估计生存时间的联合分布

贝叶斯模型

机器学习

预测和预测性能

功效分析

模拟

图形

本节尝试列出一些在事件历史分析中可能很有用的专用绘图函数。

其他

CRAN 包

核心cmprsk, eha, mstate, muhaz, rms, survival, timereg.
常规addhazard, AER, aftgee, ahaz, APtools, asaur, asbio, aster, aster2, BMA, bnnSurvival, boot, boot.pval, bpcp, bshazard, bujar, casebase, censReg, CFC, clinfun, cmprskQR, coarseDataTools, coin, compareC, compound.Cox, condGEE, condSURV, controlTest, coxme, coxphf, coxphw, coxrobust, coxsei, crrSC, csci, currentSurvival, Cyclops, DAAG, dblcens, discSurv, DTDA, dynpred, dynsurv, ELYP, emplik, emplik2, Epi, epiR, etm, exactRankTests, fastcox, FHtest, fitdistrplus, flexmsm, flexrsurv, flexsurv, frailtyEM, frailtyHL, frailtypack, frailtySurv, gamboostMSM, gamlss.cens, gbm, gcerisk, gems, genSurv, GJRM, glmnet, glmpath, GORCure, gss, GSSE, gte, hdnom, icenReg, ICGOR, icRSF, ICsurv, IDPSurvival, InformativeCensoring, intccr, interval, intsurv, invGauss, ipred, JM, JMbayes, joineR, joineRML, joint.Cox, km.ci, kmc, kmi, KMsurv, KONPsurv, landest, LearnBayes, LexisPlotR, locfit, logconcens, LogicReg, logspline, lpc, lsmeans, LTRCtrees, maxcombo, maxstat, mboost, MCMCglmm, MCMCpack, mets, mexhaz, miCoPTCM, MicSim, mixAK, mixPHM, MLEcens, mmcif, msm, msmtools, MST, multcomp, multipleNCC, MultSurvTests, mvna, NADA, NPHMC, NPMLEcmprsk, npsurv, OrdFacReg, pamr, party, pch, pec, penalized, PenCoxFrail, penMSM, peperr, PermAlgo, PHeval, plac, plsRcox, polspline, powerSurvEpi, PReMiuM, prodlim, psbcGroup, pseudo, quantreg, randomForestSRC, ranger, rankhazard, reda, relsurv, reReg, rhosp, riskRegression, risksetROC, RobustAFT, rpart, rstanarm, rstpm2, saws, SemiCompRisks, SemiMarkov, SGL, simexaft, SimHaz, simMSM, simPH, simsurv, SimSurvNMarker, smcure, smoothHR, SMPracticals, spatstat, spBayesSurv, spef, SSRMST, superpc, surv2sampleComp, survAUC, survC1, SurvCorr, survex, survexp.fr, survey, survIDINRI, survivalMPL, survivalROC, SurvLong, survminer, survMisc, survPresmooth, SurvRegCensCov, survRM2, survsim, survSNP, SvyNom, tdROC, thregI, timeROC, TP.idm, TPmsm, tpr, TraMineR, TransModel, tranSurv, TSHRC, uniah, VGAM, vitality, vsd, xgboost, YPmodel.
已归档concreg, FamEvent, imputeYn, jackknifeKME.

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